Codzienność roku 1965 przynosiła kard. Stefanowi Wyszyńskiemu na przemian dobre i złe wiadomości. Wiele radości sprawiła prośba Wydawnictwa "Pallottinum" o napisanie słowa wstępnego do przekładu Pisma Świętego na język polski z języków oryginalnych. Była to praca zespołu biblistów, którzy chcieli dać wierzącym Stary i Nowy Testament we współczesnej polszczyźnie. Do tej bowiem pory posługiwano się Biblią w przekładzie ks. Jakuba Wujka z 1599 r., nieznacznie zmodernizowaną w latach 30. dwudziestego stulecia. Ponieważ w zamyśle autorów nowego wydania polskiego przekładu Pisma Świętego miało ono ukazać się na Millenium Chrztu Polski, nazwano je Biblią Tysiąclecia i pod taką nazwą funkcjonuje do dzisiaj.

W słowie wstępnym Ksiądz Prymas napisał między innymi:

Ta błogosławiona praca, dokonana jako dzieło milenijne, wyjdzie na spotkanie pragnień człowieka współczesnego, będzie zaradzać głodom nadchodzących pokoleń, których łaknienie można wyrazić słowami Amosa: "Oto idą dni, mówi Pan i puszczę głód na ziemię: nie głód chleba ani pragnienia wody, ale słuchania Słowa Bożego" (Am 8, 11) .

W niecały rok później kard. Wyszyński wydał dekret o zastosowaniu tego tłumaczenia w tekstach liturgicznych.

23 czerwca odbyła się 88. Konferencja Plenarna Episkopatu Polski. Podczas jej obrad biskupi uchwalili kilka dokumentów: wskazania dla spowiedników w zakresie spowiedzi współmałżonków, list pasterski Na 20-lecie organizacji kościelnej na Ziemiach Zachodnich i Północnych oraz list pasterski O pomocy Polski katolickiej dla czwartej sesji Soboru Watykańskiego Drugiego.

W liście Na 20-lecie organizacji kościelnej na Ziemiach Zachodnich i Północnych biskupi polscy przypomnieli fakty związane z organizowaniem duszpasterstwa na tzw. Ziemiach Odzyskanych i znaczenie, jakie miały one dla Polski i Kościoła. Wskazali także na dokonania dwudziestolecia. Podkreślili także, iż Episkopat opowiada się za tym, że Ziemie Zachodnie w myśl przyrodzonej sprawiedliwości są nieodłącznie związane z macierzą. W kolejnych sformułowaniach listu padły ważne, ze względu na najbliższą przyszłość, zdania o relacji do narodu niemieckiego:

Katolicy polscy będą pamiętać, że są członkami jednej rodziny ludzkiej i wspólnie z innymi narodami odkupieni są najdroższą krwią Chrystusa: dzięki tej wyjątkowej cenie należą do Kościoła powszechnego. Przełamywać będą niechęć do innych narodów, do wszystkich odnosząc się z chrześcijańską życzliwością. Wyraził to już kiedyś kard. prymas Hlond (...): "Chcemy żyć ze wszystkimi w zgodzie i w ludzkim braterstwie. Chcemy dobrych i na wzajemnym zaufaniu opartych stosunków z sąsiadami. Przebaczyliśmy wiele, bardzo wiele. I dziś jeszcze raz przebaczamy wszystko. Wyrzekliśmy się nienawiści. Nie szukamy zemsty".

W liście pasterskim, dotyczącym Soboru, biskupi wskazali na zbieżność Soboru i Wielkiej Nowenny przed Tysiącleciem Chrztu Polski w idei odnowy przez oddanie się Bogu. Zaprosili wiernych do wsparcia modlitewnego Soboru. 14 września, w dniu otwarcia czwartej sesji, we wszystkich polskich świątyniach, na specjalnych nabożeństwach, miano prosić o dary Ducha Świętego dla ojców sobrowych. Wzywali także do modlitw i ofiar przez cały czas trwania soborowych obrad.