Specyfiką konwentu w Kaliszu ma być pogłębione życie modlitwy, stąd klasztor ten jest nazywany Domem Modlitwy, w którym docelowo bracia mają mieszkać wg Reguły dla pustelni, którą napisał św. Franciszek z Asyżu. W ciągu dnia bracia zachowują milczenie – rozmawiają ze sobą tylko przy posiłkach. Nie prowadzą pracy duszpasterskiej „na zewnątrz”. Codziennie zapraszają na Mszę św. o godz. 7, a w niedzielę – o godz. 8.15. Każdego wieczoru od godz. 20 do 21 można razem z zakonnikami adorować w ciszy Najświętszy Sakrament i odmówić kompletę. Bracia będą posługiwać także w sakramencie spowiedzi.

W homilii podczas Mszy św. inauguracyjnej biskup kaliski Damian Bryl prosił franciszkanów, aby Dom modlitwy spełniał swoje zadanie. – Bardzo potrzebujemy tego miejsca, które zawsze było miejscem modlitwy, gdzie z szacunkiem wspominamy siostry klaryski i tych, którzy tutaj zawsze się modlili. Prosimy, abyście tradycję tej modlitwy podjęli i żeby to miejsce było miejscem uwielbienia Pana naszego Jezusa Chrystusa, jedynego Boga i Zbawiciela – powiedział kaznodzieja.