Aby jak najlepiej przeżyć ważny dla społeczności szkolnej jubileusz i godnie uczcić swojego patrona, od kilku miesięcy pod przewodnictwem dyrektor Joanny Gołubkiewicz podejmowane były różnorodne działania, które wszystkim przybliżały postać Ojca Świętego i Jego przesłanie zawarte w nauczaniu. W salach lekcyjnych zostały wykonane gazetki tematyczne o patronie szkoły oraz plakaty w formie collage. Starsi uczniowie wzięli udział w happeningu „Myśli Jana Pawła II”. Ich prace plastyczne ozdobiły i wzbogaciły wystawę zgromadzonych pamiątek w Sali Patrona. Zorganizowano również konkurs wiedzy o Janie Pawle II oraz konkurs na znaczek okolicznościowy związany z jubileuszem. Chętni uczniowie pisali wiersze na cześć patrona szkoły, które zostały opublikowane w wydanym tomiku Na srebrnej strunie. Przygotowana prezentacja multimedialna i wystawa zdjęć ,,25 lat z Janem Pawłem II” umożliwia wszystkim zapoznanie się z tym, jak nasz patron towarzyszył szkole w wielu radosnych wydarzeniach i inspirował do czynienia dobra na przestrzeni minionych lat.

Ważnym punktem w przygotowaniu się do jubileuszu było złożenie przez uczniów i nauczycieli ,,Daru duchowego” w postaci zorganizowanej przez 25 dni modlitwy różańcowej w intencjach zawsze bliskich Papieżowi: za rodziny, za Ojczyznę i o pokój na świecie. Drugim darem było włączenie się do 25 akcji charytatywnych i dobroczynnych.

Społeczność szkoły wraz z pocztem sztandarowym wzięła czynny udział 13 maja w Nabożeństwie Fatimskim, aby przez Maryję dziękować za dar Jana Pawła II i Jego naukę oraz prosić o dalszą opiekę i potrzebne łaski Boże dla dzieci, młodzieży, nauczycieli i wszystkich pracowników szkoły. W tych samych intencjach modlili się podczas uroczystej Mszy św. w kościele parafialnym św. Andrzeja Boboli oraz w cerkwi prawosławnej. W modlitwach pamiętano także o zmarłych uczniach i pracownikach.

Punktem kulminacyjnym srebrnego jubileuszu była wieczornica zorganizowana 18 maja w rocznicę urodzin Jana Pawła II, z udziałem zaproszonych gości: m.in. biskupa seniora, księży, burmistrza, dyrektorów szkół i innych placówek w Siemiatyczach. Uczestnicy spotkania powitani przez dyrektor szkoły, po wspólnym odśpiewaniu hymnu szkoły oraz wysłuchaniu historii szkoły, obejrzeli przygotowany przez nauczycieli i młodzież ciekawy spektakl, w którym były ukazane wartości wypływające z nauczania Ojca Świętego oraz recytowane fragmenty wierszy Karola Wojtyły. Był to czas pełen refleksji nad wielkością postaci Papieża-Polaka i pięknem Jego nauczania.

Od samego początku Jan Paweł II jest przedstawiany jako niekwestionowany autorytet moralny i wzór do naśladowania. W Planie wychowawczym szkoły są umieszczane działania mające na celu poznawanie życia, działalności i nauczania papieża oraz sposoby wdrażania Jego nauki w codziennym życiu.

Realizując poszczególne działania, szkoła od 2001 r. bierze udział w Ogólnopolskiej Pielgrzymce Rodziny Szkół im. Jana Pawła II na Jasną Górę. Przystępuje do wielu ogólnopolskich i wojewódzkich konkursów plastycznych, recytatorskich, literackich i wiedzy, często osiągając sukcesy w finale lub półfinale. Szczególnym osiągnięciem jest to, że 9 razy uczniowie naszej szkoły reprezentowali województwo podlaskie w finale ogólnopolskich konkursów wiedzy o Janie Pawle II. W roku 2012 nasza szkoła była gospodarzem i współorganizatorem IV Ogólnopolskiej Olimpiady Myśli Jana Pawła II.